原标题:德国NMR网络正在加速全球SARS-CoV-2病毒蛋白相关研究 来源:cnBeta.COM
当 SARS-CoV-2 病毒发生突变时,意味着最初的遗传信息已经发生了改变,比如某个特定点位的氨基酸 / 病毒蛋白发生了交换。为快速评估这种变化可能产生的影响(比如蛋白质功能、或与潜在药物和抗体的相互作用),科学家们可以借助强大的三维图像技术来研究病毒蛋白。而从 COVID-19 大流行开始,法兰克福歌德大学和达姆施塔特大学的研究人员们,就在积极地与国际研究团队展开相关合作。
站在核磁共振(NMR)光谱仪上的 Martin Hengesbach 和 Andreas Schlundt
SCI Tech Daily 报道称,位于德国法兰克福歌德大学的祖尔格实验室,已经汇集了来自全球 17 个国家或地区的研究网络的 80% 的 SARS-CoV-2 蛋白信息。
其旨在使用核磁共振波谱(NMR)来描述 SARS-CoV-2 分子的三维结构。首先是利用特殊的同位素原子来标记分子,然后将之暴露于强磁场中。然后借助 NMR 来高效、仔细地查看潜在的活性化合物是如何与病毒蛋白结合的。
上述操作是在该校生物分子磁共振中心(BMRZ)和其它地点完成的,但研究的前提,还需要为相关测试准备大量具有高纯度和稳定性的蛋白质、并以正确的方式对其进行折叠。
据悉,这一遍布全球的研究网络,由歌德大学有机化学与化学生物学研究所的 Harald Schwalbe 教授负责协调。而制定用于生产蛋白质的实验室规程,也已经抵达了第二个里程碑。
除了蛋白质,科学家们还对 SARS-CoV-2 病毒的 RNA 链展开了深入调查。去年的时候,研究团队已经对其所有重要的 RNA 片段提供了访问。
凭借 129 名同事的专业知识,现其已能够完全实现“试管”操作,大量生产及纯化 SARS-CoV-2 近 30 种蛋白质中的 23 种。
通过将这些蛋白质的遗传信息整合到环状的小 DNA 片段(质粒)中并植于细菌体上,就可以产出所需的蛋白质。
在分离并富集了由无细胞系统产生的一些特殊蛋白质后,研究人员便可通过 NMR 光谱来评估其是否仍能够正确折叠。
歌德大学有机化学与化学生物学研究所的 Martin Hengesbach 博士解释称:
歌德大学分子生物科学研究所的 Andreas Schlundt 博士补充道:
与此同时,NMR 联盟也没有停下相关工作的脚步,目前研究人员正在努力检索病毒蛋白是否能够与潜在的药物相结合。