北京市水务局水质水生态监测中心完成了《2021年北京市水生态监测及健康评价报告》，148个被监测水体中，处于健康等级的水体占比达85.8%。全市水生态健康状况总体良好，水生生物多样性稳步提升。
市水务局于2019年开始，每年发布《北京市水生态监测及健康评价报告》。与2020年相比，2021年水生态监测站点由66个增至166个，评价水体由48个增至148个，涵盖了全市五大水系的主要水体和第一、二批湿地名录中的全部湿地。通过对河湖生境指标、水生生物等水生态要素的监测和数据收集，分析评价水生态系统的健康和变化情况，可以为水生态系统保护和修复提供依据，对加快推进本市水生态文明建设具有重要意义。
2021年的报告显示，全市累计调查鱼类61种，已恢复到历史最高水平的72%；每年过境候鸟有300万只左右，其中不乏灰鹤等二级保护动物，丹顶鹤、白头鹤、白枕鹤等国家一级保护动物。水生态健康状况的持续向好，为全市野生动植物种群的逐步增长创造了条件。目前，北京已经成为世界上水生生物多样性最丰富的首都之一。
此外，2021年监测到的浮游植物种类达447种、浮游动物达304种、底栖动物达230种；调查到的大型水生维管束植物达81种，生物多样性显著提升。
2021年北京迎来丰水年，全市平均降雨量924毫米，81处干涸多年的泉眼复涌，部分干旱和季节性断流的河流恢复生机。全市有水河流同比增加47条，有水河长增加852.99公里，有水面积增加 77.78平方公里。密云水库实现了建库以来最高蓄水量35.79亿立方米。年底平原区地下水位同比回升5.64米，已连续6年回升。
