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本报讯(记者王昊昊 通讯员杨泽茂)中国农科院麻类研究所联合国内外3家单位,通过基因组、转录组、表观修饰组联合分析的手段,揭示了黄麻耐盐适应机制和驯化历史,并通过全基因组关联分析(GWAS)发现黄麻11个重要性状的候选位点。相关成果近日发表于《植物杂志》。
黄麻是全球第二大天然纤维作物,种植面积占全球韧皮纤维的80%。科研人员联合使用多种测序技术,对黄麻耐盐品种TC008-41的基因组进行测序、组装以及注释,通过构建13种植物的最大似然树对黄麻适应性进化中的基因家族扩张和收缩进行评估。
结果表明,扩张的基因家族通过DNA修复和清除活性氧,增强了黄麻对非生物胁迫的抵抗力。进一步研究发现,在基因家族驯化过程中,进化基因具有明显的表观遗传和转录表达变化,并且一些重要进化基因具有明显的耐盐GWAS信号,可能在植物盐胁迫适应性形成中发挥重要作用,这对黄麻耐盐性的分子育种具有重要意义。
论文审稿人认为,这项成果通过多组学研究,报告了高质量黄麻参考基因组、256份黄麻种质基因组重测序、11个农艺性状的GWAS和黄麻对盐胁迫反应的多组学分析;通过大规模重测序了解了黄麻的进化历史,揭示了与耐盐性、纤维产量和纤维品质等重要育种性状相关的基因,解析了黄麻耐盐等逆境适应机理。
该研究为与耐盐性和纤维相关的黄麻育种提供了宝贵的遗传资源,并为了解黄麻的环境适应性、驯化和改良遗传基础以及一些重要性状提供了重要信息。
相关论文信息:https://doi.org/10.1111/tpj.15983