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《自然-地球科学》
研究发现植被根区储水全球模式
美国斯坦福大学Stocker Benjamin D.研究小组近日取得一项新成果。他们发现了植被根区储水的全球模式。相关成果日前发表于《自然-地球科学》。
研究团队通过结合蒸散量、太阳诱导荧光和辐射估算的遥感植被活动,从降水和蒸散发时间序列计算出累积水分亏缺之间的关系,估算了全球根区储水能力。研究结果表明,在地球37%的植被表面,植物可利用的水分超过2米深土壤的储水量。研究发现,植物根部蓄水区生物群落变化与观测到的根区深度相关,并受当地水文气候的影响,这可以通过年度累积水亏缺极端值的大小来衡量。但较小尺度的变化与地形和土地利用方式有关。
他们的发现记录了根区有效储水能力的巨大空间变化,并阐明了水分亏缺的气候学、植被的生根深度及其对水分胁迫的敏感性之间的紧密联系。
研究人员表示,根区储水能力即植物可获得的水量,控制着干旱时期陆地-大气水和碳交换的敏感性。根区储水量在空间上如何变化难以直接观测,因此目前在很大程度上是未知的。
相关论文信息:
https://doi.org/10.1038/s41561-023-01125-2
《自然-生物技术》
单细胞映射可鉴定区分癌症细胞靶抗原
韩国科学技术院Jung Kyoon Choi、Jung Kyoon Choi等合作,近期在逻辑门的CAR开关组合靶抗原单细胞映射研究领域取得进展。相关论文2月16日在线发表于《自然-生物技术》。
鉴定区分癌症细胞和正常组织细胞的最佳靶抗原,仍是嵌合抗原受体(CAR)细胞治疗肿瘤内异质性肿瘤的艰巨挑战。
研究人员通过构建单细胞表达图谱,将组织复杂性分解到单个细胞水平,该图谱整合了来自412个肿瘤和12个正常器官的约140万肿瘤、肿瘤浸润正常细胞和参考正常细胞。他们使用随机森林和卷积神经网络两步筛选方法,选择最有助于区分单个恶性细胞和正常细胞的基因对。并基于单个细胞中配对基因的组合表达模式,评估AND、OR和NOT逻辑门的肿瘤覆盖率和特异性。
单细胞转录组偶联表位分析验证了卵巢癌症和结直肠癌中确定的AND、OR和NOT开关靶点。
相关论文信息:
https://doi.org/10.1038/s41587-023-01686-y
《细胞》
一种天然衍生物可作为口服抗结核药物
美国得克萨斯农工大学James C. Sacchettini团队发现,天然产物衍生的sequanamycin可作为有效的口服抗结核药物。2月23日,相关研究发表于《细胞》。
研究人员报告了一系列被称为sequanamycin的大环内酯类化合物,它们在体外和体内对结核分枝杆菌(Mtb)具有显著的活性。sequanamycin是一种细菌核糖体抑制剂,与核糖体相互作用的方式和经典大环内酯类药物(如红霉素和克拉霉素)类似,但具有结合特性,使它们能够克服结核分枝杆菌固有的大环内酯类耐药性。结合抑制剂的核糖体结构被用于优化sequanamycin,进而生产先进的先导化合物SEQ-9。SEQ-9在急性和慢性结核模型中作为单一药物有效,并在小鼠结核感染模型中与其他结核药物联合使用显示出杀菌活性。这些结果支持进一步研究该类化合物作为结核病临床候选药物,有可能成为治疗药物敏感和耐药结核病的新方案。
相关论文信息:
https://doi.org/10.1016/j.cell.2023.01.043
科学家发现细胞谱系特异性线粒体恢复力
英国剑桥大学Patrick F. Chinnery研究小组发现,哺乳动物器官发育过程中细胞谱系特异性线粒体恢复力。2月23日,《细胞》杂志在线发表了这项成果。
研究人员发现,涉及必要线粒体基因的细胞谱系特异性表达谱出现在母体发育早期,包括在器官形成之前出现的组织特异性亚型。然而,核转录特征并非独立于细胞器功能。研究人员用两种不同的mtDNA突变从遗传学上干扰线粒体内蛋白质合成,诱导细胞谱系特异性代偿反应(包括以前不涉及细胞器维护的分子途径),发现基因表达下调,已知其表达会加剧外基因线粒体毒素的影响,这表明胚胎发育过程中对线粒体功能障碍的转录适应。补偿既是组织和突变特定的,也是在促进细胞器恢复力的转录因子控制之下。这可能有助于形成人类线粒体疾病的组织特异性,并成为器官定向治疗的潜在目标。
研究人员表示,线粒体活性在器官之间有显著差异,但尚不清楚这种差异是如何以及何时产生的。
相关论文信息:
https://doi.org/10.1016/j.cell.2023.01.034