象腿蕉花序
本报讯(记者朱汉斌)中科院华南植物园海外学者John Seymour Heslop-Harrison教授领导的研究团队,在象腿蕉染色体级别基因组组装研究方面取得新进展。相关研究近日发表于Giga Science。
象腿蕉是芭蕉科中耐寒的蕉类植物,原产于中国云南和东南亚地区,具有重要的观赏、饲用和药用价值。研究人员采用单分子纳米孔、Illumina测序策略,结合染色体构象捕获技术,发表了首个象腿蕉染色体级别的基因组序列,长度为481.5 Mbp,完整性较高(BUSCO 98.3%),注释获得36836个编码基因,重复序列约占基因组的55%。
比较基因组学研究发现,象腿蕉长末端重复序列的组成及其插入时间与芭蕉属物种有差异,芭蕉属比象腿蕉有更多Copia,象腿蕉长末端重复插入时间(峰值3.5~5 Mya)比芭蕉属物种(峰值2 Mya)更古老;还发现芭蕉科内9和11染色体基数进化过程中复杂多样的染色体重组事件。
研究结果为蕉类作物保育和改良提供了重要的基因组资源。
相关论文信息:
https://doi.org/10.1093/gigascience/giac027