近期,斯坦福大学的科研人员完成了利用人工智能计算加速工作流程的DNA巨量测序技术,把人类基因组测序时间缩短至5小时2分钟,创造了新的世界纪录。研究成果发表在《The New England Journal of Medicine》期刊,标题为“Ultrarapid Nanopore Genome Sequencing in a Critical Care Setting”。
科研人员利用一台由48个测序单元组成的新设备(称为flow cells)对同一个人的基因组进行测序,读取的数据直接存入云储存系统。随后,通过算法扫描输入的样本基因代码,识别出可能导致疾病的遗传突变。最后,科研人员将患者的基因变异与致病基因的公开数据库进行比较,从而诊断出患者的遗传病因。在此过程中,确保测序高效准确的关键是长读测序技术和新设备flow cells。研究中共招募了12名患者,其中5人从测序信息中获得了基因诊断(其余7人的患病原因与基因无关),诊断率为42%,比平均水平高出约12%。处理速度最快的病例样本,仅用5小时2分钟就完成测序。从血样送至实验室到初步诊断,最快的一例病例仅耗时7小时18分钟,而此前世界最快纪录是14小时。
这项研究开发了一种超快速基因组测序技术,为加快基因诊断、提高临床救治水平提供了有效方法。
论文链接:
https://www.nejm.org/doi/full/10.1056/NEJMc2112090
注:此研究成果摘自《The New England Journal o f Medicine》期刊,文章内容不代表本网站观点和立场,仅供参考。